MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 62120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015732	ATT	2	6	18	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015732	GAAA	2	8	65	72	75 %	0 %	25 %	0 %	339498646
3	NC_015732	CAG	2	6	87	92	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498646
4	NC_015732	GAA	2	6	99	104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
5	NC_015732	CATT	2	8	128	135	25 %	50 %	0 %	25 %	339498646
6	NC_015732	AGA	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
7	NC_015732	ATT	3	9	159	167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498646
8	NC_015732	GAA	2	6	225	230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
9	NC_015732	A	6	6	284	289	100 %	0 %	0 %	0 %	339498646
10	NC_015732	ACA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
11	NC_015732	ACA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
12	NC_015732	ACA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
13	NC_015732	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498646
14	NC_015732	ATA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498646
15	NC_015732	A	6	6	506	511	100 %	0 %	0 %	0 %	339498646
16	NC_015732	TCCTT	2	10	530	539	0 %	60 %	0 %	40 %	339498646
17	NC_015732	AC	3	6	567	572	50 %	0 %	0 %	50 %	339498646
18	NC_015732	TACA	2	8	594	601	50 %	25 %	0 %	25 %	339498646
19	NC_015732	CTG	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498646
20	NC_015732	AAAT	2	8	698	705	75 %	25 %	0 %	0 %	339498646
21	NC_015732	CTT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498646
22	NC_015732	CAAAA	2	10	750	759	80 %	0 %	0 %	20 %	339498646
23	NC_015732	ATG	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498646
24	NC_015732	TAA	2	6	809	814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498646
25	NC_015732	TCTG	2	8	860	867	0 %	50 %	25 %	25 %	339498646
26	NC_015732	CCA	2	6	915	920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339498646
27	NC_015732	A	6	6	951	956	100 %	0 %	0 %	0 %	339498646
28	NC_015732	GTAA	2	8	1002	1009	50 %	25 %	25 %	0 %	339498646
29	NC_015732	AGC	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498646
30	NC_015732	CAA	2	6	1107	1112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498646
31	NC_015732	TCTT	2	8	1196	1203	0 %	75 %	0 %	25 %	339498646
32	NC_015732	A	7	7	1220	1226	100 %	0 %	0 %	0 %	339498646
33	NC_015732	TTC	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498646
34	NC_015732	CGG	2	6	1319	1324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498646
35	NC_015732	ATGC	3	12	1344	1355	25 %	25 %	25 %	25 %	339498646
36	NC_015732	GAA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498646
37	NC_015732	TTA	2	6	1459	1464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015732	TG	3	6	1466	1471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015732	ATA	2	6	1484	1489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015732	AGT	2	6	1492	1497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015732	ATA	2	6	1571	1576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015732	AAG	2	6	1590	1595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015732	CTA	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015732	TAC	3	9	1608	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015732	TAA	2	6	1617	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015732	TA	3	6	1624	1629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015732	AAG	2	6	1632	1637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015732	ATTT	2	8	1655	1662	25 %	75 %	0 %	0 %	339498647
49	NC_015732	AGA	2	6	1835	1840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
50	NC_015732	AAAAT	2	10	1924	1933	80 %	20 %	0 %	0 %	339498647
51	NC_015732	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
52	NC_015732	A	7	7	1953	1959	100 %	0 %	0 %	0 %	339498647
53	NC_015732	TGA	3	9	2090	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
54	NC_015732	GAC	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498647
55	NC_015732	A	6	6	2190	2195	100 %	0 %	0 %	0 %	339498647
56	NC_015732	TTA	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
57	NC_015732	TGA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
58	NC_015732	A	7	7	2308	2314	100 %	0 %	0 %	0 %	339498647
59	NC_015732	TTA	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498647
60	NC_015732	ATC	2	6	2338	2343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498647
61	NC_015732	CCG	2	6	2381	2386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498647
62	NC_015732	GTA	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498647
63	NC_015732	AGA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
64	NC_015732	GAA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498647
65	NC_015732	T	6	6	2717	2722	0 %	100 %	0 %	0 %	339498647
66	NC_015732	GTTT	2	8	2781	2788	0 %	75 %	25 %	0 %	339498648
67	NC_015732	T	6	6	2835	2840	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
68	NC_015732	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
69	NC_015732	CTT	2	6	2905	2910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498648
70	NC_015732	ATC	2	6	2992	2997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
71	NC_015732	TGA	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
72	NC_015732	CCT	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339498648
73	NC_015732	TAT	2	6	3092	3097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498648
74	NC_015732	T	6	6	3097	3102	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
75	NC_015732	ACG	3	9	3140	3148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498648
76	NC_015732	T	6	6	3153	3158	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
77	NC_015732	TCTA	2	8	3183	3190	25 %	50 %	0 %	25 %	339498648
78	NC_015732	AAG	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498648
79	NC_015732	TCA	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498648
80	NC_015732	CGA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498648
81	NC_015732	GAT	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
82	NC_015732	A	6	6	3692	3697	100 %	0 %	0 %	0 %	339498648
83	NC_015732	TGAACA	2	12	3716	3727	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	339498648
84	NC_015732	T	7	7	3731	3737	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
85	NC_015732	T	6	6	3740	3745	0 %	100 %	0 %	0 %	339498648
86	NC_015732	GAA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498648
87	NC_015732	GAT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339498648
88	NC_015732	TTCT	2	8	3840	3847	0 %	75 %	0 %	25 %	339498649
89	NC_015732	T	6	6	3851	3856	0 %	100 %	0 %	0 %	339498649
90	NC_015732	TAAG	2	8	3867	3874	50 %	25 %	25 %	0 %	339498649
91	NC_015732	CAA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498649
92	NC_015732	TGGAAC	2	12	3954	3965	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	339498649
93	NC_015732	TCG	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498649
94	NC_015732	TTCCT	2	10	4054	4063	0 %	60 %	0 %	40 %	339498649
95	NC_015732	TAAT	2	8	4071	4078	50 %	50 %	0 %	0 %	339498649
96	NC_015732	GTT	2	6	4184	4189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498649
97	NC_015732	CATA	2	8	4289	4296	50 %	25 %	0 %	25 %	339498649
98	NC_015732	AT	3	6	4309	4314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015732	AGTAA	2	10	4384	4393	60 %	20 %	20 %	0 %	339498650
100	NC_015732	GGC	2	6	4438	4443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339498650
101	NC_015732	CGT	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498650
102	NC_015732	CGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498650
103	NC_015732	A	6	6	4517	4522	100 %	0 %	0 %	0 %	339498650
104	NC_015732	AAGGG	2	10	4565	4574	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015732	TTC	2	6	4785	4790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498651
106	NC_015732	TTGT	2	8	4862	4869	0 %	75 %	25 %	0 %	339498651
107	NC_015732	ATC	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015732	TC	3	6	4937	4942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015732	TCC	2	6	4950	4955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015732	AT	3	6	5100	5105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015732	GAA	2	6	5124	5129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498652
112	NC_015732	TGT	2	6	5159	5164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498652
113	NC_015732	CCG	2	6	5205	5210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339498652
114	NC_015732	AAC	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
115	NC_015732	CAA	2	6	5262	5267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
116	NC_015732	ATC	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498652
117	NC_015732	GAA	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339498652
118	NC_015732	ATAAGG	2	12	5452	5463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339498652
119	NC_015732	GTT	2	6	5586	5591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339498652
120	NC_015732	TTC	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
121	NC_015732	CAG	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
122	NC_015732	CT	3	6	5709	5714	0 %	50 %	0 %	50 %	339498652
123	NC_015732	G	6	6	5727	5732	0 %	0 %	100 %	0 %	339498652
124	NC_015732	A	6	6	5866	5871	100 %	0 %	0 %	0 %	339498652
125	NC_015732	A	6	6	5886	5891	100 %	0 %	0 %	0 %	339498652
126	NC_015732	TCA	2	6	5902	5907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498652
127	NC_015732	GTACCT	2	12	6000	6011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339498652
128	NC_015732	TA	3	6	6036	6041	50 %	50 %	0 %	0 %	339498652
129	NC_015732	CTT	2	6	6049	6054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
130	NC_015732	TTC	2	6	6079	6084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339498652
131	NC_015732	ACG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339498652
132	NC_015732	CTG	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339498652
133	NC_015732	ATT	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339498652
134	NC_015732	T	6	6	6241	6246	0 %	100 %	0 %	0 %	339498652
135	NC_015732	AAT	2	6	6251	6256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339498652
136	NC_015732	A	7	7	6323	6329	100 %	0 %	0 %	0 %	339498652
137	NC_015732	CAA	2	6	6340	6345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
138	NC_015732	CAA	2	6	6406	6411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498652
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397	NC_015732	AAC	2	6	20405	20410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339498666
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401	NC_015732	CAT	2	6	20590	20595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339498666
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